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| Registros recuperados: 65 | |
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| NARCISO, M. G.; VALDISSER, P. A. M. R.; BENÍCIO, C. G.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P.. |
| A Embrapa Arroz e Feijão utiliza a plataforma de genotipagem BeadXpress Reader (Illumina), que utiliza a fluorescência como método de detecção. A interface gráfica foi construída utilizando-se a linguagem JavaScript. Para exemplificar o acesso e o uso do Alchemy Web, foram utilizados dados obtidos em feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.), no Laboratório de Biotecnologia da Embrapa Arroz e Feijão, através da plataforma BeadXpress (Illumina). |
| Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) |
Palavras-chave: Software; Interface gráfica; Marcador molecular. |
| Ano: 2014 |
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/984524 |
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| Pessanha,Patrícia Gomes de Oliveira; Viana,Alexandre Pio; Amaral Júnior,Antonio Teixeira do; Souza,Ricardo Moreira de; Teixeira,Milena Carvalho; Pereira,Messias Gonzaga. |
| O objetivo do presente trabalho foi avaliar a diversidade genética entre 20 acessos de Psidium spp. (UENF 1830 a UENF 1849, UENF- Universidade Estadual do Norte Fluminense) por marcadores RAPD. Vinte e oito primers foram utilizados, gerando um total de 157 bandas. Os marcadores moleculares RAPD foram capazes de revelar a existência de diversidade entre os 20 acessos de Psidium. Para a interpretação dos dados, o índice Nei e Li foi utilizado. Com base na análise do agrupamento hierárquico UPGMA e o método de otimização Tocher, essa diversidade pôde ser observada pela presença de acessos similares e divergentes |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Dissimilaridade; Marcador molecular; Análise multivariada. |
| Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452011000100018 |
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| BERNARDINO, K. da C.; MENEZES, C. B. de; PASTINA, M. M.; SOUSA, S. M. de; GUIMARAES, C. T.; SOUZA, D. A. de; SCHAFFERT, R. E.; MAGALHAES, J. V. de. |
| Por causa da crescente expansão do cultivo de sorgo em áreas do cerrado brasileiro, cujos solos são altamente intemperizados, resultando em baixo pH, deficiência de fósforo (P) e toxidez causada pelo alumínio (Al), torna-se necessário o desenvolvimento de cultivares adaptadas a essa condição. A tolerância ao Al em sorgo ocorre via exsudação de ácidos orgânicos ativada por Al nos ápices radiculares. Uma vez na rizosfera, o citrato forma um complexo estável com os íons Al3+, reduzindo os efeitos tóxicos do metal no sistema radicular. Ácidos orgânicos como o citrato podem também liberar o P adsorvido nas partículas do solo, facilitando a absorção pelas raízes. A Embrapa Milho e Sorgo gerou marcadores gene-específicos para o gene SbMATE, que codifica um... |
| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) |
Palavras-chave: Genética; Sorghum bicolor; Marcador molecular; Mutação. |
| Ano: 2016 |
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1063979 |
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| Radmann,Elizete Beatriz; Bianchi,Valmor João; Oliveira,Roberto P. de; Fachinello,José Carlos. |
| O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade genético-molecular, por marcadores RAPD, das dez principais cultivares de morangueiro utilizadas no País: Aromas, Bürkley, Camarosa, Campinas, Dover, Milsei-Tudla, Oso Grande, Santa Clara, Sweet Charlie e Vila Nova. O DNA foi extraído de folhas maduras, as análises RAPD foram realizadas com 26 primers e os produtos de amplificação separados por eletroforese. O coeficiente de Dice foi utilizado para estimar a similaridade genética entre as cultivares e o método UPGMA para gerar o fenograma por meio do NTSYS. Houve amplificação de fragmentos consistentes com 19 primers, tendo sido encontrado polimorfismo em 14. Dos 116 fragmentos gerados, 84 foram polimórficos. As cultivares foram classificadas em dois... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Fragaria x ananassa Duch.; RAPD; Fingerprint; Marcador molecular. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362006000100017 |
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| Zimback,Léo; Barbosa,Wilson; Mori,Edson Seizo; Veiga,Renato Ferraz de Arruda. |
| Foi realizada a caracterização genética das cultivares de pêssego Tropical e Douradão pelo método RAPD, em comparação com 'Dourado-1', 'Tutu', 'Maravilha', 'Rubro-sol', 'Flordaprince', 'Aurora-1' e 'Talismã' do Banco Ativo de Germoplasma de Frutas de Caroço do IAC, mantido no Núcleo de Agronomia de Capão Bonito, utilizando DNA extraído de folhas jovens. Foram obtidos 31 marcadores genéticos a partir dos primers altamente polimórficos OPAD10, OPAE04, OPAE07, OPAE09, OPAE11, OPAJ04 e OPAJ06, selecionados de 96 primers avaliados. Os marcadores RAPD utilizados indicaram eficientemente o grau de parentesco entre cultivares, exceto em cultivares originadas de polinização livre. Verificou-se que, mesmo entre as cultivares irmãs como 'Tutu' e 'Talismã',... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Prunus persica (L.) Batsch; Pêssego var. persica; Marcador molecular; Distância genética. |
| Ano: 2003 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452003000200045 |
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| Melo,Carlos Lasaro Pereira de; Ragagnin,Vilmar Antônio; Arruda,Klever Marcio Antunes; Barros,Everaldo Gonçalves de; Carneiro,Pedro Crescêncio Souza; Paula Júnior,Trazilbo José de; Moreira,Maurilio Alves; Carneiro,José Eustáquio de Souza. |
| O objetivo deste estudo foi a caracterização fenotípica e molecular de 31 genótipos de feijão do tipo carioca, quanto à resistência aos patógenos da antracnose, ferrugem e mancha-angular. Foram realizadas inoculações com 13 patótipos de Colletotrichum lindemuthianum, dois de Uromyces appendiculatus e sete de Pseudocercospora griseola. Na caracterização molecular, foram utilizados cinco marcadores moleculares previamente identificados, ligados a diferentes alelos de resistência aos patógenos. Sete genótipos apresentaram resistência a 12 patótipos de C. lindemuthianum. Nove genótipos apresentaram resistência a cinco patótipos de P. griseola. Dez genótipos foram resistentes aos patótipos de U. appendiculatus. As linhagens VC 2, VC 3 e VC 5, além da Rudá-R... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Colletotrichum lindemuthianum; Phaseolus vulgaris; Pseudocercospora griseola; Uromyces appendiculatus; Marcador molecular; Melhoramento do feijoeiro. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000400008 |
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| Carneiro,P.L.S.; Malhado,C.H.M.; Affonso,P.R.A.M.; Euclydes,R.F.; Carneiro,A.P.S.; Cunha,E.E.; Souza,L.G.R.. |
| Determinou-se o número adequado de repetições na comparação de métodos de seleção tradicionais e associados a marcadores moleculares, com diferentes tamanhos efetivos e sob diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados, usando simulação com o programa GENESYS. Para comparar os diferentes métodos de seleção utilizaram-se populações com tamanhos efetivos de 18,18 (TE1) e de 66,66 (TE2) e uma, 10 e 30 repetições por geração, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Para as situações com apenas uma repetição, os resultados apresentaram incoerências, independentemente do tamanho efetivo (TE1 ou TE2) ou do sistema de acasalamento (RAA - reprodutores acasalados aleatoriamente, EIC - exclusão de irmãos completos ou EICMI - exclusão de irmãos... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: BLUP; Marcador molecular; Tamanho efetivo de população; Sistema de acasalamento. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352008000400024 |
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| Paixão,D.M.; Braccini Neto,J.; Paiva,S.R.; Carneiro,P.L.S.; Pinto,A.P.G.; Sousa,K.R.S.; Nascimento,C. Souza do; Verardo,L.L.; Hidalgo,A.M.; Lopes,P.S.; Guimarães,S.E.F.. |
| Mapeou-se quantitative trait loci (QTL) associados a características de desempenho nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X de suínos pertencentes a uma população F2, formada a partir do cruzamento entre dois machos da raça naturalizada brasileira Piau e 18 fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain). O mapa genético de ligação da população foi construído após a genotipagem dos animais para 35 marcadores microssatélites. As estimativas do conteúdo de informação polimórfica indicaram que os marcadores microssatélites foram adequados para as análises de QTL. Os dados foram analisados pelo mapeamento por intervalo usando-se o programa GridQTL. Encontraram-se seis QTL, sendo que o QTL genômico para idade ao abate atingiu a significância de 5% de... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Raça Piau; Marcador molecular; Nível genômico; Suíno. |
| Ano: 2013 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352013000100031 |
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| Peixoto,M.G.C.D.; Martinez,M.L.; Teodoro,R.L.; Machado,M.A.; Carvalho,M.R.S.; Gomes,F.C.; Verneque,R.S.. |
| O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do método de regressão em detectar QTL com base na utilização de dados da estrutura de família (irmãos completos e meios-irmãos), como aqueles gerados em um núcleo MOET. Foram simulados dados fenotípicos e genotípicos em uma estrutura de núcleo MOET fechado de seleção. Três arquivos foram analisados, contendo: a) informações conjuntas de irmãos completos e meios-irmãos; b) apenas informações de irmãos completos e c) apenas informações de meios-irmãos. Verificou-se que o método da regressão, para dados discretos ou contínuos, foi capaz de detectar associações entre marcador e QTL em níveis bastante expressivos de significância (P<0.001 e P<0,0001), quando se utilizou o arquivo que continha informações... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: QTL; Poder de detecção; Marcador molecular; Estrutura de família. |
| Ano: 2009 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352009000400024 |
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| Gomes,Patrícia Cristina; Ribeiro,Ricardo Pereira; Sirol,Rodolfo Nardez; Lopera-Barrero,Nelson Maurício; Moreira,Heden Luiz Marques; Povh,Jayme Aparecido; Mangolin,Claudete Aparecida; Vargas,Lauro; Jacometo,Carolina Bespalhok; Streit Júnior,Danilo Pedro. |
| O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de um estoque de Salminus brasiliensis utilizado em programas de repovoamento do rio Paranapanema, por meio do marcador RAPD. Dez reprodutores (cinco machos e cinco fêmeas) e sua progênie (40 larvas e 40 alevinos) foram analisados. Os oito iniciadores analisados produziram 96 fragmentos, dos quais 81,2% foram polimórficos. Houve diferença significativa na frequência de 32 dos 96 fragmentos, com a presença de um fragmento exclusivo nos alevinos. O índice de Shannon, a percentagem de fragmentos polimórficos e a distância e a identidade genética mostraram menor divergência genética entre os reprodutores e as larvas, além de diminuição da variabilidade nos alevinos. A divergência genética foi menor... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Salminus brasiliensis; Marcador molecular; Peixe; RAPD; Programas de repovoamento. |
| Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000200008 |
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| Pinheiro,Cassia Renata; Amorim,Julie Anne Espíndola; Diniz,Leandro Eugenio Cardamone; Silva,Adriano Márcio Freire da; Talamini,Viviane; Souza Júnior,Manoel Teixeira. |
| O objetivo deste trabalho foi identificar isolados brasileiros de Ralstonia solanacearum quanto a filotipos e sequevares, determinar sua diversidade genética, realizar a associação da estrutura genética do patógeno com sua classificação e origem geográfica e identificar um marcador molecular para a diagnose do moko-da-bananeira. Um grupo de 33 isolados de R. solanacearum, da coleção da Embrapa Tabuleiros Costeiros, coletado de diversos hospedeiros, foi caracterizado por meio de PCR em sequência palindrômica extragênica repetitiva (rep-PCR) e RAPD. Deste grupo, 19 perteciam à raça 2 do patógeno e 14 à raça 1, e 15 isolados eram associados à cultura da bananeira. Os filotipos e sequevares foram caracterizados e determinados por PCR Multiplex. Verificou-se... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Musa; Marcador molecular; Moko-da-bananeira; Murcha bacteriana; Rep-PCR; Variabilidade genética. |
| Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000600004 |
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| Povh,Jayme Aparecido; Ribeiro,Ricardo Pereira; Sirol,Rodolfo Nardez; Streit Júnior,Danilo Pedro; Lopera-Barrero,Nelson Mauricio; Vargas,Lauro; Gomes,Patrícia Cristina; Lopes,Taís da Silva. |
| O objetivo deste trabalho foi estudar a diversidade genética das amostras de pacu do médio Rio Paranapanema e do estoque de reprodutores utilizado no programa de repovoamento da Estação de Aqüicultura e Hidrologia da usina hidrelétrica Duke Energy, por meio do marcador RAPD. Foram utilizados 14 primers para analisar 30 indivíduos capturados no médio Rio Paranapanema e 29 indivíduos do estoque de reprodutores. O índice de diversidade genética de Shannon e a percentagem de fragmentos polimórficos foram superiores nos indivíduos capturados do Rio Paranapanema. A similaridade genética foi maior nos indivíduos do estoque de reprodutores. A análise da variância molecular mostrou que a maior parte da variação está dentro de cada grupo (84,2%) e não entre os... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Piaractus mesopotamicus; RAPD; Marcador molecular; Variabilidade genética. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000200007 |
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| Rampelotti,Fátima T.; Ferreira,Anderson; Tcacenco,Fernando A.; Martins,José F. da S.; Grützmacher,Anderson D.; Prando,Honório F.. |
| O trabalho objetivou testar protocolos de extração de DNA e caracterizar populações de Tibraca limbativentris, Stål, importante inseto-praga do arroz. Os insetos foram coletados em Joinville, Rio do Oeste e Turvo, em Santa Catarina, e Agudo, Uruguaiana, Pelotas e Palmares do Sul, no Rio Grande do Sul. Testaram-se seis protocolos de extração de DNA citados na literatura, e um novo protocolo adequado à espécie em questão. DNA de dez indivíduos de cada população foi extraído usando o melhor protocolo e reações de RAPD foram realizadas com dez iniciadores. O novo protocolo mostrou os melhores resultados e foi utilizado nas reações de PCR, que geraram 151 bandas polimórficas, permitindo acessar diferenças genéticas entre todas as populações; não ocorreram... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Insecta; Percevejo-do-colmo; Arroz irrigado; Marcador molecular. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-566X2008000100004 |
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| COSTA,DANIEL FERREIRA DA; VIEIRA,FÁBIO DE ALMEIDA; FAJARDO,CRISTIANE GOUVÊA; CHAGAS,KYVIA PONTES TEIXEIRA DAS. |
| RESUMO O conhecimento da diversidade genética de espécies nativas é de grande valia quando se objetiva o melhoramento e a conservação de populações naturais. Neste sentido, o objetivodeste trabalho foi selecionar iniciadores ISSR (inter repetições de sequências simples) para Hancornia speciosa (Apocynaceae), assim como quantificar a variabilidade genética em uma população natural. Foramamostrados 15 indivíduos de uma população localizada em Natal-RN. Amostras de caule foram coletadas para a posterior extração do DNA. DNA. Para a seleção, 19 primers ISSR foram testados, dos quais seis foram eficientes, apresentando locos nítidos e em maior número (UBC 808; UBC 810; UBC 826; UBC 827; UBC 841 e UBC 842), totalizando 63 locos. Desses, apenas 30 (47,62%)... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Gargalo genético; Marcador molecular; Conservação genética. |
| Ano: 2015 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452015000400970 |
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| Leal,Jeiza Botelho; Santos,Leonardo Moreira dos; Santos,Crisliane Aparecida Pereira dos; Pires,José Luís; Ahnert,Dário; Corrêa,Ronan Xavier. |
| O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de acessos de cacau, selecionados previamente como produtivos e resistentes à vassoura-de-bruxa na Bahia, e estudar suas inter-relações com genótipos no banco de germoplasma. Amostras de DNA de folhas dos 120 acessos, coletados em 17 fazendas de sete municípios do Sul da Bahia, foram amplificadas pela técnica de RAPD ("random amplified polymorphic DNA"). Os coeficientes de dissimilaridade genética, calculados pelo método de Jaccard a partir das bandas RAPD, permitiram evidenciar, pela análise de agrupamento, que a maioria das seleções das fazendas (89,2%) agrupou-se com acessos do banco de germoplasma considerados representativos da diversidade de cacau (híbridos, trinitários, Scavinas,... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Theobroma cacao; Marcador molecular; Melhoramento genético; Vassoura-de-bruxa. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000700009 |
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| COSTA, R. V. da; SILVA, D. D. da; COTA, L. V.; PARREIRA, D. F.; ZAMBOLIM, L.; GOMES, E. A.; LANA, U. G. de P.; NEVES, W. dos S.; FIGUEIREDO, J. E. F.. |
| A antracnose do milho causada pelo fungo Colletotrichum graminicola é uma das principais doenças da cultura no Brasil e no mundo, atacando praticamente todas as partes da planta. Neste trabalho foi avaliada a variabilidade genética de 95 isolados monospóricos de C. graminicola, provenientes dos estados brasileiros de Goiás, Minas Gerais, Santa Catarina, São Paulo, Paraná e Rio Grande do Sul. O DNA de cada isolado foi amplificado via PCR, utilizando-se 15 primers ISSR (do inglês, inter-simpled sequence repeat) como marcadores moleculares. Os fragmentos de DNA gerados pelo PCR-ISSR foram avaliados por eletroforese em gel de agarose com a visualização da posição das bandas formadas nos géis. Do total de 15, nove primers foram selecionados em função do maior... |
| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) |
Palavras-chave: Variabilidade genética; UPGMA; Marcador molecular; Antracnose; Zea mays; Doença de planta; Plant diseases and disorders; Anthracnose. |
| Ano: 2014 |
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1012069 |
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| Registros recuperados: 65 | |
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